Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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