Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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