Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms