Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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ALX1Q15699 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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