Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SEC23BQ15437 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SEC23BQ15437 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SEC23BQ15437 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SEC23BQ15437 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SEC23BQ15437 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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