Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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