Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 OGG1-207ENST00000352937 1392 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.412e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-210ENST00000416333 396 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-208ENST00000383825 472 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.912e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 FN3K-205ENST00000574496 594 ntTSL 318.9■□□□□ 0.623e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 218.41■□□□□ 0.543e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.364e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.294e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.214e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.74e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.587e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.677e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.495e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.515e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MZF1-205ENST00000596039 657 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.195e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 216.11■□□□□ 0.175e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.065e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.035e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 313.59□□□□□ -0.235e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CCND1-204ENST00000539241 920 ntTSL 213.04□□□□□ -0.325e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.385e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.55e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CCND1-202ENST00000535993 568 ntTSL 211.26□□□□□ -0.615e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SERPINE2-208ENST00000473202 5989 ntTSL 28.12□□□□□ -1.115e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 GM2A-203ENST00000523466 553 ntTSL 37.19□□□□□ -1.262e-14■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.123e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 220.27■□□□□ 0.843e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.023e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.536e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 310.29□□□□□ -0.766e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 212.13□□□□□ -0.471e-10■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 59.04□□□□□ -0.961e-10■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CAPRIN2-213ENST00000542550 770 ntTSL 324.49■■□□□ 1.517e-8■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CAPRIN2-215ENST00000546129 501 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-8■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 37.9□□□□□ -1.141e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 53.47□□□□□ -1.851e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-210ENST00000537947 1100 ntTSL 324.37■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-205ENST00000535267 579 ntTSL 224.29■■□□□ 1.482e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-203ENST00000535054 460 ntTSL 323.42■■□□□ 1.342e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-216ENST00000542989 839 ntTSL 319.43■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-212ENST00000538437 747 ntTSL 218.59■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-206ENST00000536290 438 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-214ENST00000539138 511 ntTSL 315.98■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 STARD10-221ENST00000546314 620 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.712e-7■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-12■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-12■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC35E2B-201ENST00000480991 2860 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-12■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-12■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.181e-8■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-9■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-9■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC20A2-214ENST00000524237 545 ntTSL 415.13■□□□□ 0.016e-13■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC20A2-205ENST00000518717 573 ntTSL 48.39□□□□□ -1.076e-13■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SLC20A2-203ENST00000518384 557 ntTSL 47.17□□□□□ -1.266e-13■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.431e-9■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-9■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.121e-9■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-210ENST00000595176 999 ntTSL 317.52■□□□□ 0.49e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-217ENST00000599311 1005 ntTSL 516.31■□□□□ 0.29e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.139e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-213ENST00000595889 602 ntTSL 214.24□□□□□ -0.139e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.219e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.459e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.59e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.689e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 OGFOD1-201ENST00000336111 2415 ntTSL 29.12□□□□□ -0.959e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 TULP4-203ENST00000432358 424 ntTSL 36.89□□□□□ -1.319e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.024e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 514.82□□□□□ -0.044e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.754e-11■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 RAD23A-206ENST00000590881 999 ntTSL 513.12□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.756e-14■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 14.8
PCBP2Q15366 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 511.19□□□□□ -0.621e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.19□□□□□ -0.621e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.03□□□□□ -0.641e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.95□□□□□ -0.821e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.07□□□□□ -0.961e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-13■■■□□ 14.7
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