Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAPVD1Q14C86 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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