Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SHPRHQ149N8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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