Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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COL19A1Q14993 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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