Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIN2CQ14957 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms