Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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