Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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