Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTCH1Q13635 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTCH1Q13635 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTCH1Q13635 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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