Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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