Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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