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| NAE1 | Q13564 | KRT77-201 | ENST00000341809 | 3305 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.97 | □□□□□ -0.01 | | |
| NAE1 | Q13564 | ERCC1-201 | ENST00000013807 | 1278 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.97 | □□□□□ -0.01 | | |
| NAE1 | Q13564 | TUFT1-201 | ENST00000353024 | 2107 nt | TSL 2 BASIC | 14.97 | □□□□□ -0.01 | | |
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| NAE1 | Q13564 | EXO5-203 | ENST00000372703 | 2567 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.96 | □□□□□ -0.01 | | |
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| NAE1 | Q13564 | ZBTB45P1-201 | ENST00000452761 | 1456 nt | BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | VASH1-203 | ENST00000554237 | 1462 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC087164.1-202 | ENST00000583062 | 2158 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC25A32-201 | ENST00000297578 | 2891 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | EPHA5-202 | ENST00000354839 | 3427 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | CASQ1-201 | ENST00000368078 | 1897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | EPB41L4A-AS1-201 | ENST00000413221 | 2969 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC003986.2-201 | ENST00000419944 | 1711 nt | TSL 3 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | RAB3IL1-201 | ENST00000301773 | 2125 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | UCK1-203 | ENST00000372211 | 2114 nt | TSL 3 BASIC | 14.95 | □□□□□ -0.02 | | |