Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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