Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms