Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TECR-215ENST00000598918 314 ntTSL 312.96□□□□□ -0.332e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SPPL3-202ENST00000392495 2265 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ACYP1-202ENST00000357971 650 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-206ENST00000413171 4488 ntTSL 512.64□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HUWE1-212ENST00000488459 800 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-218ENST00000482171 4298 ntTSL 212.53□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-213ENST00000433212 3474 ntTSL 512.51□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 TECR-214ENST00000598715 541 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRR14-210ENST00000567989 902 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 511.5□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SDCCAG3-208ENST00000466579 496 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.63e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 210.97□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SUN1-229ENST00000475971 4038 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 DLG1-221ENST00000469371 4046 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 9
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PABPC4Q13310 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.173e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 IVNS1ABP-206ENST00000475046 1816 ntTSL 26.27□□□□□ -1.412e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.463e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.483e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 UBR5-202ENST00000517465 1095 ntTSL 25.75□□□□□ -1.493e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 45.37□□□□□ -1.553e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ADAMTSL5-211ENST00000591077 341 ntTSL 33.8□□□□□ -1.83e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.913e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.096e-20■□□□□ 9
PABPC4Q13310 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.477e-12■□□□□ 9
PABPC4Q13310 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.447e-12■□□□□ 9
PABPC4Q13310 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-18■□□□□ 9
PABPC4Q13310 STARD7-204ENST00000479456 2949 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-18■□□□□ 9
PABPC4Q13310 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.13e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-9■□□□□ 9
PABPC4Q13310 RTL8C-203ENST00000495563 578 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-20■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 217.66■□□□□ 0.421e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.189e-10■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.286e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-206ENST00000447489 750 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ANXA11-207ENST00000463340 377 ntTSL 36.04□□□□□ -1.441e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.854e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 519.06■□□□□ 0.644e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 511.75□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 213.56□□□□□ -0.243e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 211.26□□□□□ -0.613e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 29.14□□□□□ -0.953e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.83e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.83e-24■□□□□ 9
PABPC4Q13310 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-56■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.764e-10■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.864e-10■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.994e-10■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.024e-10■□□□□ 9
PABPC4Q13310 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.054e-10■□□□□ 9
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