Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1225.8 ms