Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM115Q12893 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms