Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms