Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4BQ07343 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms