Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FMODQ06828 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms