Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms