Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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