Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms