Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms