Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER3P43115 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms