Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MDH1P40925 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms