Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA3P35244 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms