Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJA4P35212 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA4P35212 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms