Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GPC1P35052 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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