Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRABP1P29762 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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