Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF1P22415 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF1P22415 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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