Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYT1P21579 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYT1P21579 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms