Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT4P19013 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms