Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XBP1P17861 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XBP1P17861 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms