Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NCK1P16333 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NCK1P16333 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NCK1P16333 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NCK1P16333 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NCK1P16333 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NCK1P16333 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NCK1P16333 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NCK1P16333 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCK1P16333 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NCK1P16333 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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