Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRF1P14222 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRF1P14222 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRF1P14222 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PRF1P14222 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms