Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEFHP12036 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms