Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TYMSP04818 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TYMSP04818 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TYMSP04818 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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