Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LRATO95237 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LRATO95237 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRATO95237 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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LRATO95237 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LRATO95237 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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LRATO95237 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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LRATO95237 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LRATO95237 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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