Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.416e-6■■■■■ 93.2
SF3B1O75533 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.924e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.41□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 220.92■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 319.62■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 318.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 418.37■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 410.91□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 410.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -11e-7■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-206ENST00000487350 785 ntTSL 1 (best)23.67■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 SH3BP5-204ENST00000412806 1900 ntTSL 522.33■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 SH3BP5-207ENST00000450625 763 ntTSL 318.33■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-205ENST00000482246 414 ntTSL 317.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 516.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-212ENST00000542302 4323 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-205ENST00000440394 7040 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -03e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-201ENST00000347735 4955 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-204ENST00000471891 578 ntTSL 313.41□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-210ENST00000497317 477 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-209ENST00000492892 430 ntTSL 312.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-207ENST00000490672 3264 ntTSL 212.55□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-221ENST00000588412 2071 ntTSL 212.02□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LCLAT1-211ENST00000491680 1610 ntTSL 211.93□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-208ENST00000491084 598 ntTSL 311.8□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 511.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LCLAT1-209ENST00000478015 1862 ntTSL 211.18□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-218ENST00000545948 2881 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.928e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 WDPCP-205ENST00000409354 2122 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-208ENST00000538971 2267 ntTSL 27.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.58e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 KRTCAP2-202ENST00000461136 271 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 DLEU2-204ENST00000433070 698 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 DLEU2-207ENST00000458725 1657 ntTSL 212.2□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 29.8□□□□□ -0.849e-16■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 NAA25-205ENST00000549711 2933 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 NAA25-208ENST00000552527 5815 ntTSL 24.56□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 93.1
SF3B1O75533 EXOC4-204ENST00000460346 762 ntTSL 410.38□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 93
SF3B1O75533 DLG1-204ENST00000392381 2833 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 93
SF3B1O75533 PEAK1-210ENST00000569159 531 ntTSL 421.56■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 93
SF3B1O75533 PEAK1-208ENST00000567337 555 ntTSL 418.82■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 93
SF3B1O75533 SLC25A39-211ENST00000588767 807 ntTSL 516.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 93
SF3B1O75533 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 ATP2C1-217ENST00000509662 559 ntTSL 425.94■■□□□ 1.749e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 ATP2C1-209ENST00000505072 556 ntTSL 413.47□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 513.07□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 521.42■■□□□ 1.027e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 43.22□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-206ENST00000524500 573 ntTSL 420.71■□□□□ 0.917e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 418.99■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 417.64■□□□□ 0.417e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 417.62■□□□□ 0.417e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 317.31■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 516.82■□□□□ 0.287e-10■■■■■ 92.9
SF3B1O75533 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 416.59■□□□□ 0.257e-10■■■■■ 92.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1416.6 ms