Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SCN2BO60939 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN2BO60939 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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