Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGTAO43765 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGTAO43765 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGTAO43765 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGTAO43765 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGTAO43765 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms