Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA2O00451 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms