Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms