Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E5RI56 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E5RI56 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E5RI56 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E5RI56 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms